Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVW-1Q9UQF0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms