Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAK1Q9UPV9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRAK1Q9UPV9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRAK1Q9UPV9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1666.8 ms