Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SETD1BQ9UPS6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
SETD1BQ9UPS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SETD1BQ9UPS6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SETD1BQ9UPS6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms