Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF8Q9UPN6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms