Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC12A4Q9UP95 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A4Q9UP95 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A4Q9UP95 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms