Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FZD1Q9UP38 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FZD1Q9UP38 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FZD1Q9UP38 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FZD1Q9UP38 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms