Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRQQ9UMZ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
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