Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNPO2Q9UMS6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNPO2Q9UMS6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNPO2Q9UMS6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms