Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PADI3Q9ULW8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PADI3Q9ULW8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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