Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CIZ1Q9ULV3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CIZ1Q9ULV3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CIZ1Q9ULV3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CIZ1Q9ULV3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CIZ1Q9ULV3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CIZ1Q9ULV3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms