Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP2Q9ULQ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP2Q9ULQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP2Q9ULQ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP2Q9ULQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP2Q9ULQ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP2Q9ULQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP2Q9ULQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP2Q9ULQ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRIP2Q9ULQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP2Q9ULQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms