Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG4Q9ULP0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms