Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMKLBQ9ULI2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms