Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
INO80Q9ULG1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
INO80Q9ULG1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms