Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA3Q9UL41 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PNMA3Q9UL41 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA3Q9UL41 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms