Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI9

POU2F3, POU domain, class 2, transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU2F3Q9UKI9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POU2F3Q9UKI9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU2F3Q9UKI9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU2F3Q9UKI9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms