Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPREB3Q9UKI3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms