Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC5Q9UII4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HERC5Q9UII4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERC5Q9UII4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms