Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPA4Q9UI42 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms