Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMPXQ9UHP9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPXQ9UHP9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms