Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FBXO40Q9UH90 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FBXO40Q9UH90 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO40Q9UH90 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms