Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN8Q9UBY8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms