Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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