Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
POLKQ9UBT6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLKQ9UBT6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLKQ9UBT6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms