Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EIF3KQ9UBQ5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EIF3KQ9UBQ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms