Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XCL2Q9UBD3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XCL2Q9UBD3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XCL2Q9UBD3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms