Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLCO1C1Q9NYB5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLCO1C1Q9NYB5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLCO1C1Q9NYB5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLCO1C1Q9NYB5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms