Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A1Q9NY26 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A1Q9NY26 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A1Q9NY26 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms