Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX43Q9NXZ2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX43Q9NXZ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX43Q9NXZ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms