Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVK13-1Q9NX77 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK13-1Q9NX77 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms