Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB20Q9NX57 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB20Q9NX57 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms