Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX18Q9NVP1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX18Q9NVP1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX18Q9NVP1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms