Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETD4Q9NVD3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD4Q9NVD3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms