Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM30AQ9NV96 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM30AQ9NV96 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM30AQ9NV96 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms