Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ATG3Q9NT62 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ATG3Q9NT62 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATG3Q9NT62 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms