Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EMILIN3Q9NT22 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMILIN3Q9NT22 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EMILIN3Q9NT22 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms