Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOMER3Q9NSC5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOMER3Q9NSC5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms