Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A11Q9NSA0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A11Q9NSA0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A11Q9NSA0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A11Q9NSA0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A11Q9NSA0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A11Q9NSA0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A11Q9NSA0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A11Q9NSA0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A11Q9NSA0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A11Q9NSA0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A11Q9NSA0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A11Q9NSA0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A11Q9NSA0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms