Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRMQ9NS64 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRMQ9NS64 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPRMQ9NS64 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRMQ9NS64 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRMQ9NS64 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRMQ9NS64 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRMQ9NS64 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRMQ9NS64 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRMQ9NS64 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRMQ9NS64 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms