Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CD163L1Q9NR16 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CD163L1Q9NR16 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CD163L1Q9NR16 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CD163L1Q9NR16 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CD163L1Q9NR16 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CD163L1Q9NR16 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CD163L1Q9NR16 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CD163L1Q9NR16 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CD163L1Q9NR16 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.1 ms