Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC31BQ9NQW1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEC31BQ9NQW1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms