Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN3Q9NQS3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms