Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYLDQ9NQC7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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