Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTAC1Q9NQ79 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRTAC1Q9NQ79 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRTAC1Q9NQ79 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms