Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ34

TMEM9B, Transmembrane protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9BQ9NQ34 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM9BQ9NQ34 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM9BQ9NQ34 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms