Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A2Q9NQ11 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A2Q9NQ11 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms