Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM138Q9NPI0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM138Q9NPI0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms