Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FZD3Q9NPG1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FZD3Q9NPG1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms