Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C6orf50Q9HD87 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C6orf50Q9HD87 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
C6orf50Q9HD87 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms