Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM8AQ9HCN3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM8AQ9HCN3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM8AQ9HCN3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM8AQ9HCN3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM8AQ9HCN3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM8AQ9HCN3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM8AQ9HCN3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM8AQ9HCN3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms